ATLANTE
DELL’ESPRESSIONE GENICA NEL CERVELLO
Si è calcolato che oltre il 60% dei geni di un mammifero è
direttamente o indirettamente implicato nello sviluppo e nelle funzioni del
sistema nervoso. Solo una parte esigua di tali geni è estesamente studiata,
mentre per ciò che concerne l’insieme degli altri, i ricercatori sono come
scalatori ai piedi di un’alta montagna, la cui vetta è ancora nascosta da una
fitta coltre di nubi.
Lo studio della topografia dell’espressione genica assume, in questa fase della ricerca neurogenetica e delle sue applicazioni, un’importanza cruciale perché contribuisce alla definizione di una griglia di criteri che consentiranno di inquadrare il ruolo dei singoli geni nell’economia complessiva dello sviluppo e della fisiologia del sistema nervoso.
Una delle applicazioni più immediate della conoscenza dell’espressione
genica ad un alto grado di risoluzione, è la caratterizzazione delle
popolazioni neuroniche.
L’Allen Institute for Brain Science (AIBS) di Seattle, ha
dedicato uno specifico programma dell’AIBS-Atlas
Project alla realizzazione di un atlante
anatomicamente completo dell’espressione genica nel cervello del topo. Lein,
con oltre cento collaboratori ed una tecnologia all’avanguardia, ha studiato i patterns
di espressione nel cervello di topo adulto di circa 20.000 geni. Lo studio è
stato condotto mediante procedure automatizzate ad alto rendimento per l’ibridizzazione
in situ e l’acquisizione dei dati (Lein
E. S. et al. Genome-wide atlas of gene expression in the adult
mouse brain. Nature 445, 168-176, 2007).
I risultati rivelano che oltre
l’80% dei geni del topo sono espressi nel
cervello.
Questa analisi, ad alta risoluzione e certamente priva di bias,
ha rivelato markers cellulari altamente
specifici ed estese evidenze di eterogeneità cellulare
non registrate negli atlanti neuroanatomici classici. Tutti i risultati sono
pubblicamente accessibili online.
Si ricorda che Lein, con Zhao e Gage, aveva già lavorato
alcuni anni fa alla realizzazione di un atlante molecolare dell’ippocampo,
studiando l’espressione di poco più di cento geni (Note e Notizie 17-07-04 Un atlante molecolare dell’ippocampo); il lavoro, pubblicato sul Journal of Neuroscience
può essere gratuitamente scaricato dal sito della rivista: http:/www.jneurosci.org/cgi/content/full/24/15/3879.
Ritornando a questo utile lavoro sull’intero genoma del topo,
che costituirà una banca-dati preziosa per molte ricerche, se ne segnala il commento
pubblicato da Nature contestualmente al lavoro (Nature 445, 160-161,
2007).
L’autrice
della nota ringrazia Isabella Floriani per la correzione della bozza.